京都賞基礎科学部門 (Kyoto Prize in the Basic Sciences)
京都賞基礎科学部門（きょうとしょうきそかがくぶもん）は、京都賞の一部門であり、優れた業績を上げた科学者に与えられる賞である。
受賞対象分野は、生物科学、数理科学、地球科学・宇宙科学、生命科学である。
京都賞基礎科学部門受賞者
1985年 クロード・エルウッド・シャノン
1986年 ジョージ・エブリン・ハッチンソン
1987年 ヤン・ヘンドリック・オールト
1988年 アブラム・ノーム・チョムスキー
1989年 イズライル・ゲルファント
1990年 ジェーン・グドール
1991年 エドワード・ノートン・ローレンツ
1992年 西塚泰美
1993年 ウイリアム・ドナルド・ハミルトン
1994年 アンドレ・ヴェイユ
1995年 林忠四郎
1996年 マリオ・レナト・カベッキ
1997年 ダニエル・ハント・ジャンゼン
1998年 伊藤清
1999年 ウォルター・ムンク
2000年 ヴァルター・ヤコブ・ゲーリング
2001年 ジョン・メイナード＝スミス
2002年 ミハイル・グロモフ
2003年 ユージン・ニューマン・パーカー
2004年 アルフレッド・ジョージ・クヌッドソンJr
2005年 サイモン・アッシャー・レヴィン
2006年 赤池弘次
2007年 金森博雄
2008年 アンソニー・ポーソン